作家甲于2001年2月创作完成一部小说，4月与出版社协商出版事宜，5月出版社同意出版，7月由出版社正式出版，甲取得该小说

选项A正确。修改权，是指修改或授权他人修改作品的权利。作品表达了作者的思想、情感和观点，公之于众后会直接影响社会公众对作者人格的评价，因而法律赋予作者修改权是对作者人格的尊重。修改通常是指对内容的修改，报社、杂志社进行的不影响作品内容的文字性删节不属修改权控制的范围，可以不经作者同意。但对内容的修改，必须征得作者同意。本案中，出版社未经作者同意，擅自将小说的内容（狗熊写成三只腿的动物）进行修改（改为狗熊写成四只腿的动物），侵犯了作者的修改权。选项B正确。保护作品完整权，是指保护作品不受歪曲、篡改的权利。作品是作者思想的反映，也是作者人格的延伸。歪曲、篡改作品不仅损害作品的价值，而且直接影响作者的声誉，因而法律禁止任何人以任何方式歪曲和篡改作品。本案中，出版社未经作者同意，擅自对作品进行篡改，侵犯了作者的保护作品完整权。选项C正确。署名权，是指表明作者身份，在作品上署名的权利。其具体内容包括：（1）决定是否在作品上署名；（2）决定署名的方式，如署真名、笔名；（3）决定署名的顺序；（4）禁止未参加创作的人在作品上署名；（5）禁止他人假冒署名，即有权禁止他人盗用自己的姓名或笔名在他人作品上署名。因此，作者有权决定在自己作品上署笔名，出版社未经作者同意，擅自将作者的笔名改为真名的，侵犯了作者的署名权。选项D错误。发行权，即以出售或者赠与方式向公众提供作品的原件或者复制件的权利。本案中，作者崔雪应出版社约稿出书就是为了销售。因此，书店从出版社批发《森林之歌》销售的行为并未侵犯作者的发行权。