国家级环境质量标准由（）组织制定。

法律依据为《环境保护法》第15条的规定，国务院环境保护主管部门制定国家环境质量标准。省、自治区、直辖市人民政府对国家环境质量标准中未作规定的项目，可以制定地方环境质量标准；对国家环境质量标准中已作规定的项目，可以制定严于国家环境质量标准的地方环境质量标准。地方环境质量标准应当报国务院环境保护主管部门备案。

本题考查环境标准制度。 A、B项：《环境保护法》第16条第1款规定：“国务院环境保护主管部门根据国家环境质量标准和国家经济、技术条件，制定国家污染物排放标准。”据此，国家污染物排放标准应根据国家环境质量标准制定，A项正确；国家污染物排放标准由国务院环境保护主管部门制定，B项也正确。
C项：《环境保护法》第15条第2款规定：“省、自治区、直辖市人民政府对国家环境质量标准中未作规定的项目，可以制定地方环境质量标准；对国家环境质量标准中已作规定的项目，可以制定严于国家环境质量标准的地方环境质量标准。地方环境质量标准应当报国务院环境保护主管部门备案。”据此，省级政府在国家环境质量标准中未作规定的项目可制定地方环境质量标准，但应向国务院环境保护主管部门备案，C项正确。
D项：《环境保护法》第16条第2款规定：“省、自治区、直辖市人民政府对国家污染物排放标准中未作规定的项目，可以制定地方污染物排放标准；对国家污染物排放标准中已作规定的项目，可以制定严于国家污染物排放标准的地方污染物排放标准。地方污染物排放标准应当报国务院环境保护主管部门备案。”据此，地方污染物排放标准由省级人民政府制定，并向国务院环境保护主管部门备案，D项错误。

【考点】环境质量标准的制定。详解：《环境保护法》第15条规定：国务院环境保护行政主管部门制定国家环境质量标准。省、自治区、直辖市人民政府对国家环境质量标准中未作规定的项目，可以制定地方环境质量标准；对国家污染物排放标准中已作规定的项目，可以制定严于国家污染物排放标准的地方污染物排放标准。地方污染物排放标准应当报国务院环境保护主管部门备案。因此，本题应选A项。

在各级标准的优先执行关系上，环境保护标准与产品质量标准截然不同，环境质量标准以国家级标准为主，地方环境质量标准补充制定国家级标准中没有的项目，国家级标准和地方级标准同时执行。