根据《中国—澳大利亚自由贸易协定》，自澳大利亚进口实施特殊保障管理措施的农产品数量超过触发水平时，海关按照（）对超量进口的有关农产品征收税款。A、普通税率B、暂定税率C、协定税率D、最惠国税率

选项AB：适用最惠国税率的进口货物有暂定税率的，应当适用暂定税率；选项CD：适用协定税率、特惠税率的进口货物有暂定税率的，应当从低适用税率；选项E：适用普通税率的进口货物，不适用暂定税率。

根据《中华人民共和国进出口关税条例》第十一条的规定，適用最惠国税率的进口货物有暂定税率的，应当适用暂定税率；适用协定税率、特惠税率的进口货物有暂定税率的，应当从低适用税率：适用普通税率的进口货物，不适用暂定税率。适用出口税率的出口货物有暂定税率的，应当适用暂定税率。据此可知，B项的表述错误。

选项C：适用协定税率、特惠税率的进口货物有暂定税率的，应当从低适用税率。

《中华人民共和国进出口关税条例》第10条规定：“原产于共同适用最惠国待遇条款的世界贸易组织成员的进口货物，原产于与中华人民共和国签订含有相互给予最惠国待遇条款的双边贸易协定的国家或者地区的进口货物，以及原产于中华人民共和国境内的进口货物，适用最惠国税率。
原产于与中华人民共和国签订含有关税优惠条款的区域性贸易协定的国家或者地区的进口货物，适用协定税率。
原产于与中华人民共和国签订含有特殊关税优惠条款的贸易协定的国家或者地区的进口货物，适用特惠税率。
原产于本条第一款、第二款和第三款所列以外国家或者地区的进口货物，以及原产地不明的进口货物，适用普通税率。”
《中华人民共和国进出口关税条例》第11条规定：“适用最惠国税率的进口货物有暂定税率的，应当适用暂定税率；适用协定税率、特惠税率的进口货物有暂定税率的，应当从低适用税率；适用普通税率的进口货物，不适用暂定税率。
适用出口税率的出口货物有暂定税率的，应当适用暂定税率。”
《中华人民共和国进出口关税条例》第12条规定：“按照国家规定实行关税配额管理的进口货物，关税配额内的，适用关税配额税率；关税配额外的，其税率的适用按照本条例第十条、第十一条的规定执行。”

[解析]《中华人民共和国进出口关税条例》第十一条规定，适用最惠国税率的进口货物有暂定税率的，应当适用暂定税率；适用协定税率、特惠税率的进口货物有暂定税率的，应当从低适用税率；适用普通税率的进口货物，不适用暂定税率.

对原产于与我国签订含有特殊关税优惠条款的贸易协定的国家或地区的进口货物，按特惠税率征收。

对原产于与我国签订含有特殊关税优惠条款的贸易协定的国家或地区的进口货物，按特惠税率征收。